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Trans mRNA splicing in trypanosomes

Trypanosomes are parasitic protozoa, including species that cause tropical diseases. In trypanosomes all protein-coding mRNAs are generated through trans splicing, whereby each protein-coding exon is joined with a noncoding spliced leader (SL) miniexon. Our interests in this area focus on the regulation and the mechanism of trans splicing, and a general goal is to define the differences between the trans splicing and the conventional cis splicing mechanisms (for example, see Palfi et al., 2000; Wang et al., 2006). A detailed understanding should open up new avenues in the fight against trypanosome-caused diseases, such as the African sleeping sickness or the Chagas disease. Currently we are adapting genomewide approaches mentioned above (RNA-Seq; iCLIP) to the trypanosome system. A specific focus is the detailed study of the role of the trypanosome SMN protein in the biogenesis of small nuclear ribonucleoproteins, a factor that when misregulated in the human system results in Spinal Muscular Atrophy (SMA) disease. The trypanosome system provides here a simple model system for a disease-relevant splicing factor (Palfi et al., 2009; Jaé et al., 2011).