Molekulare Enzymologie des DNA Fehlpaarungsreparatursystems (MMR)
AG Friedhoff
Molekulare Enzymologie des DNA Fehlpaarungsreparatursystems (MMR)
Die Reparatur von DNA-Schäden ist ein wichtiger Schritt zum Erhalt der Genomintegrität. Fehler in DNA-Reparaturwegen resultieren in Mutationen, Genominstabilität und können beim Menschen zu Krebs führen. Die Reparaturprozesse werden in einem Mehrstufenprozess von komplizierten molekularen Maschinen ausgeführt.
Wir untersuchen die molekulare Enzymologie des evolutiv-konservierten DNA-Fehlpaarungsreparatursystem (engl. DNA mismatch repair; MMR) aus Escherichia coli.
Zur Untersuchung diese dynamischen Mehrstufen Reparaturweges verwenden wir komplementäre Herangehensweisen unter Verwendung enzymologischer, biochemischer und biophysikalischer Methoden und analysieren die Protein-Nukleinsäure und Protein-Protein-Interaktionen (Endonuklease, ATPase, Helikase). Typische biophysikalische Methoden sind Fluoreszenzspektroskopie (z.B. FRET – steady-state und pre-steady-state (Stopped-Flow)), chemisches Crosslinking (gekoppelt mit Massenspektrometrie), Interaktionsanalyse (ITC), dynamische Lichtstreuung und Circulardichroismus. In nationalen und internationalen Kooperationen kombinieren wir Einzelmolekülanalysen, hochauflösende Strukturbiologie und zeitaufgelöste biochemische und biophysikalische Assays die uns erlauben, ein integriertes Bild der Einzelschritte des MMR-System zu erhalten.