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Schisto-Datenbanken

Neuigkeiten_Juli 2017:

Auf Basis einer Organisolationsmethode haben wir Gonadengewebe aus gepaarten und ungepaarten Schistosomen für RNA-Isolation gewonnen, mit Adulten als Kontrolle. Aus insgesamt 23 Proben wurde RNA für RNA-Sequenzierung (RNA-Seq; Illumina-Plattform) isoliert, um Genexpressionsunterschiede zwischen Geschlechtern (Männchen versus Weibchen), Geweben (Testis versus Ovar) in Abhängigkeit vom Paarungszustand zu untersuchen. Die gewonnen Daten stellen eine umfassende Informationsquelle zur Reproduktionsbiologie der Schistosomen dar und dienen der Grundlagenwissenschaft sowie angewandten Forschungsaspekten.

Um Forschern die Möglichkeit zu geben, diese Daten weiter verwerten zu können, haben wir folgende Publikationen dazu veröffentlicht:

Lu, Z., Sessler, F., Holroyd, N., Hahnel, S., Quack, T., Berriman, M., Grevelding, C.G. (2017) A gene expression atlas of adult Schistosoma mansoni and their gonads. Scientific Data (in press)

Lu, Z., Sessler, F., Holroyd, N., Hahnel, S., Quack, T., Berriman, M., Grevelding, C.G. (2016) Schistosome sex matters: a deep view into gonad-specific and pairing-dependent transcriptomes reveals a complex gender interplay. Scientific Reports 6: 31150.

 

Weiterhin verweisen wir auf folgende Internetseiten (figshare und eine neues "Web-Tool", das von Zhigang Lu etabliert worden ist) für den direkten Zugang zu den Daten:


figshare:

https://doi.org/10.6084/m9.figshare.4868093.v2

https://doi.org/10.6084/m9.figshare.4884290.v2


Web-Tool:

http://schisto.xyz/geneexp

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Zugang zu Genomdaten von Schistosomen

 

http://www.genedb.org/Homepage

 

http://schistodb.net/schisto/

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http://parasite.wormbase.org/

Neuigkeiten_April 2016:

Im Namen des WormBase-Parasite-Teams hat Matt Berriman die 6. Neuauflage der "WormBaseParaSite" angekündigt, einer Internetseite für Genome von Parasiten und anderen Würmern.

Neue Genome

Neue Daten

Neue Merkmale