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Lukas Jelonek 2013

Heinrich-Buff-Ring 58

Raum: 0155

Tel.: +49 (0)641 99 35-816

Tel.: +49 (0)641 99 35-801 (Sekr.)

CV

2014-present Employment at Gießen University, Germany
2013 Employment at Bielefeld University, Germany
2010 - 2013 PhD grant “Clib Graduate Cluster”, Bielefeld University, Germany
2010 M.Sc. - Bioinformatics and genome research, Faculty of Technology, Bielefeld University, Bielefeld, Germany
2007 B.Sc. - Bioinformatics and genome research, Faculty of Technology, Bielefeld University, Bielefeld, Germany

Publications

2019

Koch, A., Höfle, L., Werner, B.T., Imani, J., Schmidt, A., Jelonek, L. and Kogel, K., 2019. SIGS vs HIGS: a study on the efficacy of two dsRNA delivery strategies to silence Fusarium FgCYP51 genes in infected host and non-host plants. Molecular plant pathology, pp.1636-1644, DOI:10.1111/mpp.12866.

2018

Zanini, S., Šečić, E., Jelonek, L. and Kogel, K., 2018. A bioinformatics pipeline for the analysis and target prediction of RNA effectors in bidirectional communication during plant-microbe interactions. Frontiers in Plant Science, p.1212.

2016

Sobetzko, P., Jelonek, L., Strickert, M., Han, W., Goesmann, A. and Waldminghaus, T., 2016. DistAMo: A Web-Based Tool to Characterize DNA-Motif Distribution on Bacterial Chromosomes. Frontiers in microbiology, p.283, DOI:10.3389/fmicb.2016.00283.

Langenkämper, D., Jakobi, T., Feld, D., Jelonek, L., Goesmann, A. and Nattkemper, T.W., 2016. Comparison of Acceleration Techniques for Selected Low-Level Bioinformatics Operations. Frontiers in genetics, p.5, DOI:10.3389/fgene.2016.00005.

Koch, A., Biedenkopf, D., Furch, A., Weber, L., Rossbach, O., Abdellatef, E., Linicus, L., Johannsmeier, J., Jelonek, L., Goesmann, A., Cardoza, V., McMillan, J., Mentzel, T. and Kogel, K., 2016. An RNAi-Based Control of Fusarium graminearum Infections Through Spraying of Long dsRNAs Involves a Plant Passage and Is Controlled by the Fungal Silencing Machinery. PLoS pathogens, p.e1005901, DOI:10.1371/journal.ppat.1005901.

Wibberg, D., Andersson, L., Tzelepis, G., Rupp, O., Blom, J., Jelonek, L., Pühler, A., Fogelqvist, J., Varrelmann, M., Schlüter, A. and Dixelius, C., 2016. Genome analysis of the sugar beet pathogen Rhizoctonia solani AG2-2IIIB revealed high numbers in secreted proteins and cell wall degrading enzymes. BMC genomics, p.245, DOI:10.1186/s12864-016-2561-1.

2015

Wibberg, D., Rupp, O., Blom, J., Jelonek, L., Kröber, M., Verwaaijen, B., Goesmann, A., Albaum, S., Grosch, R., Pühler, A. and Schlüter, A., 2015. Development of a Rhizoctonia solani AG1-IB Specific Gene Model Enables Comparative Genome Analyses between Phytopathogenic R. solani AG1-IA, AG1-IB, AG3 and AG8 Isolates. PloS one, p.e0144769, DOI:10.1371/journal.pone.0144769.

Wibberg, D., Rupp, O., Jelonek, L., Kröber, M., Verwaaijen, B., Blom, J., Winkler, A., Goesmann, A., Grosch, R., Pühler, A. and Schlüter, A., 2015. Improved genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14 as established by deep mate-pair sequencing on the MiSeq (Illumina) system. Journal of biotechnology, pp.19-21, DOI:10.1016/j.jbiotec.2015.03.005.

2014

Wibberg, D., Jelonek, L., Rupp, O., Kröber, M., Goesmann, A., Grosch, R., Pühler, A. and Schlüter, A., 2014. Transcriptome analysis of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB 7/3/14 applying high-throughput sequencing of expressed sequence tags (ESTs). Fungal biology, pp.800-813, DOI:10.1016/j.funbio.2014.06.007.

Sommer, B., Bender, C., Hoppe, T., Gamroth, C. and Jelonek, L., 2014. Stereoscopic cell visualization: from mesoscopic to molecular scale. J. Electronic Imaging, 23(1), p.011007, DOI:10.1117/1.JEI.23.1.011007.

2013

Rafiqi, M., Jelonek, L., Akum, N.F., Zhang, F. and Kogel, K., 2013. Effector candidates in the secretome of Piriformospora indica, a ubiquitous plant-associated fungus. Frontiers in plant science, 4(July), p.228, DOI:10.3389/fpls.2013.00228.

Wibberg, D., Jelonek, L., Rupp, O., Hennig, M., Eikmeyer, F., Goesmann, A., Hartmann, A., Borriss, R., Grosch, R., Pühler, A. and Schlüter, A., 2013. Establishment and interpretation of the genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB isolate 7/3/14. Journal of biotechnology, 167(2), pp.142-55, DOI:10.1016/j.jbiotec.2012.12.010.