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Biometry and Population Genetics

Selektion wird seit jeher in der Pflanzenzüchtung eingesetzt, um Individuen mit einer besonders guten beobachteten Leistung auszuwählen und mit der Zeit das Leistungsniveau einer Fruchtart zu verbessern. Die Verfügbarkeit von Markerdaten hat die Möglichkeiten zur Selektion erweitert: Sie können verwendet werden, um den genomischen Wert von Individuen zu schätzen und die Individuen mit dem besten genomischen Wert auszuwählen. So werden z. B. 100 von 300 Genotypen in Feldversuchen auf ihren Ertrag hin untersucht, mit 5000 SNP-Markern genotypisiert und anschließend wird für jeden Marker ein Effekt errechnet. Die anderen 200 Genotypen müssen dann nicht mehr in Feldversuchen angebaut, sondern nur noch genotypisiert werden, und ihr voraussichtlicher Ertrag wird anhand der zuvor berechneten Markereffekte geschätzt. Dies nennt man genomische Selektion (genomic selection) oder genomweite Vorhersage (genomewide prediction). Dieses Verfahren bildet die Basis für verschiedene Abschlussarbeitsthemen in unserer Arbeitsgruppe.

 

Selection has been used in plant breeding for a very long time in order to identify the best individuals from a breeding population and improve the performance of crops by producing progeny only from those. The availability of marker data expanded the possibilities for selection: Markers can be used to estimate the genotypic value of individuals and select those with the highest genotypic value. For example, from 300 selection candidates, 100 are evaluated for their yield in field trials. They are then genotyped with 5,000 SNP markers and an effect is assigned to each of the markers. The other 200 individuals then only have to be genotyped and their potential yield is estimated from the marker effects without the need to conduct any additional field trials. This is called genomic selection or genomewide prediction and it is the basis for different possible thesis topics at our working group.

 

 

Thesis topics

Note that all thesis topics are described in English but you can of course write your thesis in German as well.
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