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Informationen für BSc- und MSc-Arbeiten/Thesis-Projekte

Untenstehend finden Sie ausgewählte Projekte, die Sie bei uns bearbeiten können. Wir würden uns freuen wenn Sie sich für Forschung in der Pflanzenphysiologie interessieren und sind uns sicher, dass Sie mit verschiedenen molekulargenetischen, zellbiologischen und biochemischen Methoden interessante Projekte bearbeiten können. Wenn Sie Fragen haben oder sich für ein, unten nicht aufgeführtes Forschungsthema interessieren, können Sie jederzeit zu uns ins Zeughaus kommen und mit uns sprechen. Mathias Zeidler

 

BSc-Projekte

Forschung am Institut für Pflanzenphysiologie

Wir arbeiten am Photorezeptorsystem Phytochrom und versuchen mit molekularen Methoden herauszufinden, wie dieser sehr wichtige Photorezeptor Umweltsignale in Entwicklung übersetzt. Unsere Methoden umfassen die ganze Bandbreite der Molekulargenetik und Biochemie und umfasst Methoden in E. coli, Hefen und transgenen Pflanzen, Fluoreszmikroskopie, Spektroskopie, Massenspektrometrie.

  • Pflanzliche (phyA und phyB) Phytochrome; zelluläre Partner wie FHY1, Phosphatasen, etc.
  • Photobiologische Studien
  • Expression von Transgenen in Arabidopsis
  • Einsatz von fluoreszierenden Proteinfusionen; Nachweis von Proteinlokalisation und -interaktionen in vivo durch Fluoreszenzmikroskopie
  • Proteininteraktionen und -sekundärmodifikationen durch Immunopräzipitation und hochauflösende Massenspektrometrie

Lab Projekte

Zellbiologie von Phytochrom A

Die Zellbiologie von phyA ist besonders interessant hinsichtlich des FHY1-abhängigen Mechanismus der Kerntranslokation des aktivierten Photorezeptors.

  • Produktion von FHY1 (full-length sowie Domänen) sowie phyA (NPGP) in E. coli; chromatographische Reinigung; Untersuchung der Wechselwirkung in vitro.
  • Präparation / Anreicherung von Kernen aus Arabidopsis-Keimlingen
  • Untersuchungen von Keimlingen von Phosphatase Mutanten sowie entsprechenden transgenen Keimlingen
  • Zelluläre Lokalisation von phyA mit Hilfe von Fluoreszenzmikroskopie (kinetische Studien im Wildtyp und unter anderem in Mutanten)

 

Literatur

  1. Rösler, J., Jaedicke, K. & Zeidler, M. Cytoplasmic Phytochrome Action. Plant and Cell Physiology 51, 1248-1254 (2010).
  2. Rösler, J., Klein, I. & Zeidler, M. Arabidopsis fhl/fhy1 double mutant reveals a distinct cytoplasmic action of phytochrome A. Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A 104, 10737-10742 (2007).
  3. Helizon, H. et al. Arabidopsis phytochrome A nuclear translocation is mediated by a far-red elongated hypocotyl 1-importin complex. Plant J 96, 1255-1268, doi:10.1111/tpj.14107 (2018).
  4. Jaedicke, K., Lichtenthäler, A. L., Meyberg, R., Zeidler, M. & Hughes, J. A phytochrome-phototropin light signaling complex at the plasma membrane. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109, 12231-12236, doi:10.1073/pnas.1120203109 (2012).