Bioinformatische Auswertung von Microarray Daten
Bioinformatische Auswertung von Microarray Daten - jedes Sommersemester
Zielgruppe Studenten ab dem 2. klinischen Semester, nach Teilnahme am Fach Q1!
Blockkurs des Instituts für Medizinische Informatik
Dr. Pons-Kühnemann
Bei Interesse bitte E-Mail an Institut für Medizinische Informatik
(arbeitsgruppe.statistik)
Termin der Blockveranstaltung:
Vorgesehen immer im Sommersemester, der Ablauf wird noch bekannt gegeben.
Anmeldung: Sekretariat
Dozenten: Herr Dr. J. Pons-Kühnemann, Frau Dr. A. Windhorst, Herr Dr. D. Leufkens
Zielgruppe:
Studenten ab dem 2. klinischen Semester nach Teilnahme an Q1 „Medizinische Biometrie, Epidemiologie und Medizinische Informatik“
Bei Interesse bitte E-Mail an Institut für Medizinische Informatik
(arbeitsgruppe.statistik@informatik.med.uni-giessen.de)
Durchführung:
Als Blockkurs vorgesehen immer für das Sommersemester.
Zeit bzw. Umsetzung wird festgelegt, sobald der Bedarf bekannt ist und die Umsetzung feststeht.
Der Kurs kommt zustande bei min. 5 Teilnehmern (sonst Teilnahme im folgenden Sommersemester möglich).
Ein Kurstag ist in der Regel aufgeteilt auf den theoretischen Teil (vormittags) und praktische Umsetzung des erlernten (nachmittags)
Studenten ab dem 2. klinischen Semester nach Teilnahme an Q1 „Medizinische Biometrie, Epidemiologie und Medizinische Informatik“
Bei Interesse bitte E-Mail an Institut für Medizinische Informatik
(arbeitsgruppe.statistik@informatik.med.uni-giessen.de)
Durchführung:
Als Blockkurs vorgesehen immer für das Sommersemester.
Zeit bzw. Umsetzung wird festgelegt, sobald der Bedarf bekannt ist und die Umsetzung feststeht.
Der Kurs kommt zustande bei min. 5 Teilnehmern (sonst Teilnahme im folgenden Sommersemester möglich).
Ein Kurstag ist in der Regel aufgeteilt auf den theoretischen Teil (vormittags) und praktische Umsetzung des erlernten (nachmittags)
Inhalt:
Der Blockkurs gibt eine Einführung in die statistische Analyse genomischer Daten, speziell von Microarray Daten. Hierbei stehen die Expressionsanalysen und die dabei gebräuchlichen statistischen Methoden im Vordergrund. Neben
der Einführung in die theoretischen Grundlagen sind vor allem Übungen beim praktischen Umgang mit realen Daten geplant. Hierzu wird die statistische Software R ? http˛//www.r-project.org/) zusammen mit dem speziell für
bioinformatische Anwendungen entwickelten Bioconducter (http˛//www.bioconductor.org/) verwendet.
Ziel des Wahlfachs:
Einführung in die Genexpressionsanalyse. Wiederholung statistischer Methoden und Übertragung auf die Expressionsanalyse von Microarraydaten. Das Erlernen und die Anwendung von Software zur Datenanalyse (R,
Bioconductor).
Was ist nicht Ziel dieses Wahlfachs:
Ziel ist die praktische Anwendung der Verfahren. Der Schwerpunkt liegt nicht auf der theoretischen Vertiefung der Methoden und Verfahren.
Prüfung / Leistungsnachweis:
Mindestens 80%ige Teilnahme und Prüfung/Leistungsnachweis durch eine praktische Datenauswertung und deren Dokumentation
Termin der Blockveranstaltung:
Vorgesehen immer im Sommersemester
Anmeldung und Details: StudIP - wird frei geschaltet, sobald ein Termin festgelegt ist - daher bitte bei Interesse, erst eine E-Mail an arbeitsgruppe.statistik@informatik.med.uni-giessen.de
Dozenten: Herr Dr. Jörn Pons-Kühnemann
Der Blockkurs gibt eine Einführung in die statistische Analyse genomischer Daten, speziell von Microarray Daten. Hierbei stehen die Expressionsanalysen und die dabei gebräuchlichen statistischen Methoden im Vordergrund. Neben
der Einführung in die theoretischen Grundlagen sind vor allem Übungen beim praktischen Umgang mit realen Daten geplant. Hierzu wird die statistische Software R ? http˛//www.r-project.org/) zusammen mit dem speziell für
bioinformatische Anwendungen entwickelten Bioconducter (http˛//www.bioconductor.org/) verwendet.
Ziel des Wahlfachs:
Einführung in die Genexpressionsanalyse. Wiederholung statistischer Methoden und Übertragung auf die Expressionsanalyse von Microarraydaten. Das Erlernen und die Anwendung von Software zur Datenanalyse (R,
Bioconductor).
Was ist nicht Ziel dieses Wahlfachs:
Ziel ist die praktische Anwendung der Verfahren. Der Schwerpunkt liegt nicht auf der theoretischen Vertiefung der Methoden und Verfahren.
Prüfung / Leistungsnachweis:
Mindestens 80%ige Teilnahme und Prüfung/Leistungsnachweis durch eine praktische Datenauswertung und deren Dokumentation
Termin der Blockveranstaltung:
Vorgesehen immer im Sommersemester
Anmeldung und Details: StudIP - wird frei geschaltet, sobald ein Termin festgelegt ist - daher bitte bei Interesse, erst eine E-Mail an arbeitsgruppe.statistik@informatik.med.uni-giessen.de
Dozenten: Herr Dr. Jörn Pons-Kühnemann