SFB 1021 "RNA Viruses: RNA Metabolism, Host Response and Pathogenesis", Teilprojekt Z03

Kurzbeschreibung:

Infektionen mit RNA Viren resultieren in der schnellen Reprogrammierung von zellulären Signalwegen, posttranslationalen Modifikationen (PTMs), Proteininteraktionsnetzwerken und Translationsraten. Z03 stellt eine vielseitige, hochmoderne Proteomik und Bioinformatik Plattform zur proteomweiten Untersuchung und Quantifizierung von (i) Proteininteraktionen / Interaktomen, (ii) Proteinexpressionsniveaus, (iii) neu synthetisierten Proteinen (Translatome), (iv) (regulierten) PTMs und (iv) einzelnen (gereinigten) Proteinen sowie ein breites Spektrum von bioinformatischen (Meta-)-Analysen zur Untersuchung der molekularen Interaktionen bei RNA Virus Infektionen bereit.

Short summary:

Infection of target cells by RNA viruses result in the rapid reprogramming of cellular signalling, post-translational modifications (PTMs), protein interaction networks and translation rates. Z03 will provide a versatile and state of the art proteomics and bioinformatics platform to enable the proteome-wide investigation and quantification of (i) protein interactions / interactomes, (ii) protein expression levels, (iii) proteins undergoing de novo synthesis (translatomes), (iv) (regulated) PTMs and (iv) individual (purified) proteins. A broad spectrum of follow-up bioinformatics (meta-)analyses will be utilized to achieve a more holistic view on the molecular interactions during RNA virus infections.

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